Groningen Seaports omvat twee zeehavens, de haven van Delfzijl en de Eemshaven,
en twee binnenhavens, de Farmsumerhaven en de Oosterhornhaven.
Delfzijl
Al in de 16e eeuw wordt de haven van Delfzijl vermeld in maritieme geschriften. In de tweede helft van de 20e eeuw ontwikkelt zich een sterke industriële kern in het havengebied. Inmiddels is de haven van Delfzijl een internationale industriële- en handelshaven van formaat.
Eemshaven
In 1968 verklaart de Nederlandse overheid de Eemsmondregio tot economisch speerpuntgebied. Een van de kernontwikkelingen is de aanleg van een diepzeehaven, de Eemshaven. In 1973 wordt de nieuwe haven officieel geopend door H.M. Koningin Juliana. De start is aarzelend. Eind jaren negentig komt hierin verandering. De haven ontwikkelt zich inmiddels razendsnel als full-service havencomplex en logistiek knooppunt in de vaarroutes in Noordwest Europa.
De binnenhavens
Vanaf de tweede helft van de 19e eeuw wordt de binnenvaart in Groningen flink gestimuleerd. Tussen Groningen en Delfzijl wordt een nieuw kanaal gegraven; het Eemskanaal. Het kanaal geeft het binnenvaartverkeer een flinke stimulans. Door de jaren heen wordt veel infrastructureel werk verricht ter stimulering van de binnenvaart. De recente opwaardering van de vaarweg Lemmer-Delfzijl is daar het voorlopige sluitstuk van. Delfzijl heeft inmiddels twee binnenhavens, de Farmsumerhaven en de Oosterhornhaven.